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不同物种中ESCRT-III组分蛋白(VPS2 (A)、VPS20 (B)、VPS24 (C)和SNF7 (D))间的氨基酸序列比对
横线区域分别表示保守的CC结构域和SNF7结构域。
不同物种中ESCRT-I组分蛋白(VPS23 (A)、VPS28 (B)和VPS37 (C))间的氨基酸序列比对
横线区域表示UEV结构域, 虚线框中表示氨基酸保守区域。
类TOM1 (TOL)家族蛋白与动物及酵母ESCRT-0组分蛋白的氨基酸序列比对
横线标注区域分别表示VHS和GAT结构域。
拟南芥中内体蛋白分选转运装置(ESCRT)的作用机制及泛素化的膜蛋白内吞过程
胞外蛋白和营养物质及新合成的蛋白分别通过蛋白内吞和分泌途径进入反面高尔基体(TGN)。经泛素化修饰的膜蛋白被ESCRT复合物识别, 并以依赖ESCRT的作用机制通过内腔泡(ILVs)进入MVB/PVC内腔, MVB/PVC与液泡融合, 最终使货物蛋白进入液泡中降解, 与此同时ESCRT-III复合体在VPS4/SKD1 ATP水解酶的作用下解离, 进入下一个循环。PM: 质膜; MVB/PVC: 多囊泡体/液泡前体
内体蛋白分选转运装置(ESCRT)组分蛋白及其功能
保卫细胞中ABA信号转导机制模型
核糖体图谱实验流程示意图
(A) 在核糖体图谱技术(Ribo-seq)中, 多聚核糖体经RNA酶消化成单核糖体, 约30 nt的受核糖体保护的mRNA片段(RPFs)未被RNA酶降解; 将单核糖体解离, 并从中分离和纯化RPFs用于高通量测序, 仅mRNA的蛋白编码区有测序信号; (B) 搭配转录组测序(RNA-seq), 可计算出每条转录本的翻译效率, 在转录组测序中整个转录本上均有测序信号。5′UTR: 5′端非翻译区; 3′UTR: 3′端非翻译区; ORF: 开放阅读框
基因选择性剪接的模式
不同颜色的方框表示不同外显子; 方框之间的黑色直线表示内含子; 红色折线表示内含子剪接部位; 黑色箭头表示启动子控制的转录起始位点。
前体mRNA组成型剪接过程(改自Laloum et al., 2018)
SR: 富含丝氨酸和精氨酸的蛋白; hnRNP: 核不均一核糖核蛋白; snRNA: 核小RNA; snRNP: 小核核糖核蛋白; SAP: 剪接体相关蛋白; G-U-A(Y)_nAG: 内含子5?端剪接识别位点-分支位点-3?端剪接识别位点
qRT-PCR验证相关基因在月季红双喜花瓣不同发育时期的表达特性
S1-S4同图1。*表示与S1时期相比差异显著。
月季红双喜不同呈色花瓣中差异表达R2R3-MYB基因和类黄酮调控相关R2R3-MYB基因进化分析(A)及R2R3-MYB相关基因的表达热图(B)
Y和R同表2。*代表与花青素苷合成调控相关的R2R3-MYB基因。
月季红双喜花瓣中花青素苷及类胡萝卜素合成通路相关基因的表达特性分析
蓝色至红色代表基因表达由弱至强(彩图见网站版本)。*代表差异显著基因。
月季红双喜不同呈色花瓣中的基因转录特性(A)及差异表达基因KEGG聚类(B)
FDR: 错误发现率
月季红双喜不同呈色花瓣中差异LncRNA靶基因聚类(A)及差异siRNA靶基因聚类(B)
月季红双喜不同呈色花瓣中差异表达基因的功能注释
月季红双喜不同呈色花瓣中mRNA、miRNA和LncRNA的数量
月季红双喜不同发育时期花瓣呈色表型(A)、不同呈色花瓣类型中的类黄酮差异(B)及主要差异成分(C)
S1: 萼片初展期; S2: 花瓣透色期; S3: 花瓣初开期; S4: 花瓣盛开期
月季红双喜不同呈色花瓣中主要类胡萝卜素的成分含量差异
qRT-PCR所用引物
沙棘不同发育期种子和果肉中hrh-miRn458和WRI1的表达变化
(A) 沙棘种子中hrh-miRn458和WRI1的表达; (B) 沙棘果肉中hrh-miRn458和WRI1的表达。不同小写字母表示同一时期种子和果肉中hrh-miRn458与WRI1表达量间在0.05水平上差异显著。daa: 花后天数

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