整合生物学期刊网 登录      注册

野生动物学报 ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (03): 513-520.

• • 上一篇    下一篇

梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析

孙嘉良, 赵浪, 李佳丹扬, 刘垒成, 吴培福   

  1. 西南林业大学生命科学学院
    云南野生动物园
  • 出版日期:2024-08-10 发布日期:2024-08-10
  • 基金资助:
    西南林业大学科技处科研预研基金项目(110822088); 生物学质量工程项目(503190106)

  • Online:2024-08-10 Published:2024-08-10

摘要: 为探究鹿源彭氏变形杆菌(Proteus penneri)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(Cervus nippon)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对β-内酰胺类、四环素类、黏菌素类和磺胺类等多种抗生素耐药,并且携带多种抗生素外排机制编码基因;代谢通路数据库注释结果显示,注释的基因富集在42个通路上,其中新陈代谢相关注释的基因数量最多,共有2 250个基因分布在12个通路上。利用基因组测序技术分析鹿源彭氏杆菌F2d株致病性、耐药情况及代谢特点,可为预防彭氏变形杆菌感染和相关药物的研发提供理论依据。

关键词: 基因组测序, 梅花鹿, 彭氏变形杆菌, 毒力与耐药基因, 功能分析

中图分类号: