云南南部不同种源地小桐子遗传多样性的ISSR 分析

Plant Diversity ›› 2007, Vol. 29 ›› Issue (06): 619-624.

云南南部不同种源地小桐子遗传多样性的ISSR 分析

向振勇^{1 , 2 , 3} , 宋松泉² , 王桂娟² , 陈茂盛² , 杨成源² , 龙春林¹

1 中国科学院昆明植物研究所, 云南昆明 650204 ; 2 中国科学院西双版纳热带植物园, 云南勐腊 666303; 3 云南农业大学园林园艺学院, 云南昆明 650201

收稿日期:2007-04-12 出版日期:2007-12-25 发布日期:2007-12-25
通讯作者: 龙春林

Genetic Diversity of Jatropha curcas (Euphorbiaceae) Collected from Southern Yunnan, Detected by Inter-simple Sequence Repeat ( ISSR)

XIANG Zhen-Yong^{1 ,2 , 3} , SONG Song-Quan² , WANG Gui-Juan²,
CHEN Mao-Sheng² , YANG Cheng-Yuan² , LONG Chun-Lin¹

1 Kunming Institute of Botany , Chinese Academy of Sciences , Kunming 650204 , China ;
2 Xishuangbanna Tropical Botanical Garden , Chinese Academy of Sciences, Mengla 666303 , China ;
3 College of Landscape and Horticulture , Yunnan Agriculture University , Kunming 650201 , China

Received:2007-04-12 Online:2007-12-25 Published:2007-12-25
Contact: LONG Chun-Lin

摘要/Abstract

摘要： 应用ISSR 分子标记方法对采自云南的8 个居群的小桐子( Jatropha curcas) 共158 个个体进行遗传多样性分析。8 个ISSR 引物共扩增到了67 个位点, 其中61 个是多态性位点。分析结果表明: (1) 云南小桐子的遗传多样性水平很高。在物种水平上, 平均每个位点的多态位点百分率PPB = 91.04% , 有效等位基因数N_e = 1.5244, Nei′s 基因多样性指数H_e= 0.3070, Shannon 多样性信息指数H_o = 0.4618; 在居群水平上, PPB = 55.04%, N_e = 1.3826, H_e = 0.2171, Shannon 多样性信息指数H_o = 0.3178。(2) 居群间的遗传分化低于居群内的遗传分化。基于Nei's 遗传多样性分析得出的居群间遗传多样性分化系数G_st = 0.2944。AMOVA分析显示: 云南小桐子的遗传变异主要存在于居群内, 占总变异的63.50%, 居群间的遗传变异占36.50%。(3) 居群间的地理距离及遗传一致度并不存在相关性。鉴于以上指标, 我们推测云南小桐子可能来自不同的地区。

关键词: 小桐子, 遗传变异, ISSR

Abstract:

The genetic diversity of 158 individuals from eight semi-wild populations from Yunnan Province was estimated using ISSR method (8 primers). The results revealed an extraordinarily high level of genetic diversity ( at species level,
percentage of polymorphic loci PPB = 91.04% , effective number of alleles N_e = 1.5244 , Nei′s (1973 ) gene diversity H_e= 0.3070, and Shannon′s information index H_o = 0 . 4618 ; at population level, PPB = 55. 04% , N_e = 1.3826, Nei′s (1973) gene diversity H_e = 0.2171, and Shannon′s information index H_o = 0.3178). The level of genetic differentiation between populations is lower than that among populations . The low level of genetic differentiation among populations was detected, based on Nei′s genetic diversity analysis (29.44%), and AMOVA (36.50%). There is no associations between geographical distance and genetic identity.We suggest that Jatropha curcas of Yunnan Province might not be introduced from the same place.

Key words: Jatropha curcas

中图分类号:

Q 75

向振勇1 , 2 , 3 , 宋松泉2 , 王桂娟2 , 陈茂盛2 , 杨成源2 , 龙春林1 . 云南南部不同种源地小桐子遗传多样性的ISSR 分析[J]. Plant Diversity, 2007, 29(06): 619-624.

XIANG Zhen-Yong^{, ,} , SONG Song-Quan , WANG Gui-Juan,
CHEN Mao-Sheng , YANG Cheng-Yuan , LONG Chun-Lin. Genetic Diversity of Jatropha curcas (Euphorbiaceae) Collected from Southern Yunnan, Detected by Inter-simple Sequence Repeat ( ISSR)[J]. Plant Diversity, 2007, 29(06): 619-624.

[1]	高聪聪1、2, 倪军1、3, 陈茂盛1、2, 徐增富1. 能源植物小桐子赤霉素合成代谢及信号转导相关基因的鉴定及序列分析[J]. Plant Diversity, 2015, 37(2): 157-167.
[2]	吴春燕1、2, 高立志1. 六个核基因片段在中国颗粒野生稻中的单核苷酸多态性及其在群体遗传学研究中的应用[J]. Plant Diversity, 2013, 35(5): 537-546.
[3]	赵凯1、2, 王德元2, 张文娟2, 邵剑文2 . 都支杜鹃遗传多样性的ISSR分析[J]. Plant Diversity, 2013, 35(5): 578-584.
[4]	宋娟1、2, 陈茂盛1、2, 李家龙1、3, 牛龙见1、3, 徐增富1. 土施多效唑对小桐子营养生长与生殖生长的影响[J]. Plant Diversity, 2013, 35(2): 173-179.
[5]	皮雪静1、2, 潘帮珍1、2, 徐增富1. 赤霉素诱导小桐子产生两性花[J]. Plant Diversity, 2013, 35(1): 26-32.
[6]	杨春1、2, 刘爱忠1. 小桐子EST-SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析[J]. Plant Diversity, 2011, 33(5): 529-534.
[7]	蒋志敏, 陈玉霞, 包颖. 黄河三角洲柽柳居群的遗传结构和遗传分化[J]. Plant Diversity, 2011, 33(4): 403-408.
[8]	黄姝博1, 胡永红2 , 吴冬3 , 田旗1 , 李宏庆4. 福建小叶买麻藤种群的表型多样性[J]. Plant Diversity, 2010, 32(S17): 65-73.
[9]	马佳梅1 , 2 , 殷寿华1 . 西双版纳地区流苏石斛遗传多样性的ISSR 分析[J]. Plant Diversity, 2009, 31(1): 35-41.
[10]	王曦, 龙春林 . 云南小桐子资源调查与评价[J]. Plant Diversity, 2009, 31(05): 455-460.
[11]	汪书丽1 , 2 , 李巧明1 . 中国木棉居群的遗传多样性[J]. Plant Diversity, 2007, 29(05): 529-536.
[12]	何俊1 , 2 , 杨柏云1 , 陈少风1 , 高连明2 , 王红2 . 多叶重楼遗传多样性的ISSR 分析[J]. Plant Diversity, 2007, 29(04): 388-392.
[13]	王祎玲1, 2 , 赵桂仿1 . 七筋菇自然居群的遗传结构分析[J]. Plant Diversity, 2007, 29(03): 293-299.
[14]	秦虹; 宋松泉; 龙春林; 程红焱. 小桐子的组织培养和植株再生[J]. Plant Diversity, 2006, 28(06): 649-652.
[15]	张萍; 董玉芝; 魏岩; 胡成志. 利用ISSR标记对新疆白梭梭居群的遗传多样性分析[J]. Plant Diversity, 2006, 28(04): 359-362.