摘要： 【目的】通过对青钱柳全基因组序列分析，开发基因组SSR分子标记；尝试构建19个青钱柳优良药用无性系的DNA分子身份证，为后续种质资源评价、遗传多样性和种质鉴定提供技术支撑。【方法】利用MISA(microsatellite identification tool)软件对青钱柳全基因组进行SSR位点搜寻、筛选、识别及富集分析，采用Primer 3.0进行SSR引物设计；用重复性和稳定性高的SSR标记构建青钱柳无性系的识别系统。【结果】(1)从全基因组中共检测出89 741个SSR位点，SSR位点的发生频率为62.07%。(2)基因组SSR位点中单核苷酸重复单元比例最高，占总SSR位点的62.67%;六核苷酸重复单元比例最低，占0.15%;SSR位点的重复基序大多以(A/T)n为主。(3)单核苷酸和二核苷酸重复类型的SSR位点基序重复次数集中在6～16次；随重复次数增加，各SSR位点重复类型出现频率均呈下降趋势。(4)基因组SSR序列长度介于10～476 bp,不同类型重复单元的SSR序列长度存在变异性；随着重复次数的增加，SSR序列出现的频率整体呈下降趋势。(5)利用Primer 3.0成功设计出78 285对SSR引物；合成的377对中有75对引物可扩增出多态性条带；用5对单碱基重复的多态性SSR引物分析19个药用无性系，构建出无性系的二维码DNA分子身份证。【结论】青钱柳基因组SSR位点出现频率高，位点种类丰富，可为种质资源评价及指纹图谱的构建提供丰富的候选分子标记。

关键词: 青钱柳, 简单重复序列(SSR), 全基因组, DNA分子身份证

中图分类号: 

• S792.99