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热带亚热带植物学报 ›› 2024, Vol. 32 ›› Issue (03): 435-445.

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木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析

李建君, 郭鑫, 林晨俞, 王文娟, 高苗苗, 陈银华, 于晓惠   

  1. 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海南大学热带作物学院
    中国热带农业科学院热带生物技术研究所
  • 发布日期:2024-10-16
  • 基金资助:
    国家木薯产业技术体系项目(No.CARS-11-HNCYH)资助

  • Published:2024-10-16

摘要: 植物铁蛋白(Ferritin, FER)既能存储铁,又能响应各种非生物胁迫。该研究基于全基因组水平对木薯(Manihot esculenta)的FER基因家族进行分析,结果表明,从木薯中共鉴定到4个FER基因,根据系统发育树将木薯FER基因划分为2支,所有成员均包含Euk_Ferritin的功能结构域并位于叶绿体内。木薯FERs基因位于LG7~LG10染色体上;基因共线性分析表明,共有3对潜在的复制基因对,无串联重复事件;Ka/Ks值表明,MeFER同源基因经过了纯化选择;该家族含有响应激素和胁迫诱导的顺式作用元件;q RT-PCR分析表明,MeFER基因的表达具有组织特异性,MeFER4基因响应多种胁迫,且在干旱胁迫下响应最为显著。该研究为木薯FER基因家族的功能研究奠定了基础。

关键词: 木薯, FER基因, 生物信息学分析, 非生物胁迫

中图分类号: